-
1 restriction endonucleases or restriction enzymes
Рестрикционные эндонуклеазы, рестриктазы — любой бактериальный фермент, узнающий определенные нуклеотидные последовательности (сайты узнавания, см.) в двунитчатой ДНК и катализирующий разрыв внутренних связей между специфическими нуклеотидами с образованием двунитчатых разрывов с липкими или тупыми концами. Р. э., действующие на одинаковые последовательности нуклеотидов, называются изошизомерами, активность которых часто зависит от метилирования нуклеотидов в сайте рестрикции. Название рестриктазы образуется из начальных букв названия вида бактерии (напр., Escherichia coli — Eco, Bacillus amyloliquefacience — Bam) и названия штамма или типа функции (EcoR, BamH). Если какой-то хозяйский штамм имеет несколько рестрикционных ферментов, то они обозначаются римскими цифрами (EcoR I, EcoR V, Hind II), отражающими хронологию их открытия. Сайт узнавания и место разрезания обозначаются следующим образом (для EcoR I):
Р. э. можно разбить на 3 класса. Р. э. 1-го класса включают 3 субъединицы (R — рестрикция; M — метилирование, S — последовательность узнавания) и проявляют функции модификации и рестрикции, место разрезания здесь не является специфичным, ферменты этого класса не используются в технологии рекомбинантной ДНК; Р. э. 2-го класса узнают и разрывают двунитчатую ДНК в пределах определенной последовательности, состоящей из 4, 5, 6, 7 или 8 нуклеотидов. Этот класс, в свою очередь, подразделяется на несколько подклассов; Р. э. 3-го класса состоят из двух субъединиц, узнающих короткие несимметричные последовательности, связывающихся с ними и катализирующих вырезание 24–25 п. о. Применение Р. э. резко повысило эффективность анализа структуры ДНК в геномах разных организмов и дало возможность проводить работы по генной инженерии. За открытие Р. э. и их применение в молекулярной генетике В. Арбер, Х. Смит и Д. Натанс в 1978 г. удостоены Нобелевской премии.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > restriction endonucleases or restriction enzymes
-
2 polylinker
1) Биология: полилинкер (часть вектора, содержащая несколько разных участков распознавания рестриктаз)2) Генетика: полилинкер (искусственная нуклеотидная последовательность в составе векторной ДНК, содержащая несколько перекрывающихся сайтов узнавания рестриктазами)3) Иммунология: полилинкер (синтетический олигонуклеотид, содержащий сайты узнавания для рестриктаз) -
3 polylinker
полилинкер (синтетический олигонуклеотид, содержащий сайты узнавания для рестриктаз) -
4 restriction mapping
Определение положения гена на генетической (физической) карте с помощью рестриктаз restriction endonucleases; заключается в получении фрагментов анализируемой последовательности (гена), вырезанных разными рестриктазами и электрофоретически разделенных с последующим сопоставлением их размеров и определением расстояний на генетической карте; также Р.к. определение с помощью рестриктаз соотношения экзонов и интронов в составе гена (в этом случае один из вариантов - картирование по методу Берка-Шарпа Berk-Shurp method); разрешающая способность Р.к. около 20 пар нуклеотидов.* * *1. Техника конструирования рестрикционной карты конкретного участка ДНК, позволяющая определять сайты узнавания различных рестриктаз II типа в линейном масштабе: фрагменты анализируемой последовательности, или гена, вырезаются и электрофоретически (см. Электрофорез) разъединяются, затем их размеры сопоставляют и оценивают расстояние между ними на генетической карте.2. Использование рестриктаз для определения соотношения экзонов и интронов в составе к.-л. гена, для чего применяют метод Берка-Шарпа (см. Берка-Шарпа метод) и др. Разрешающая способность метода — до 20 пар нуклеотидов.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > restriction mapping
-
5 restitution analysis
1. Техника конструирования рестрикционной карты конкретного участка ДНК, позволяющая определять сайты узнавания различных рестриктаз II типа в линейном масштабе: фрагменты анализируемой последовательности, или гена, вырезаются и электрофоретически (см. Электрофорез) разъединяются, затем их размеры сопоставляют и оценивают расстояние между ними на генетической карте.2. Использование рестриктаз для определения соотношения экзонов и интронов в составе к.-л. гена, для чего применяют метод Берка-Шарпа (см. Берка-Шарпа метод) и др. Разрешающая способность метода — до 20 пар нуклеотидов.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > restitution analysis
-
6 T DNA borders
Т-ДНК границы — прямые повторяющиеся последовательности размером в 25 п. о., фланкирующие Т-область в Ti-плазмиде. Т-ДНК г. очень важны для vir-индуцируемого вырезания Т-нити после контакта бактерии с клетками растения в месте поражения, поскольку они содержат сайты узнавания для границе специфических эндонуклеаз, кодируемых vir-областью. Эндонуклеазы надрезают нижнюю нить в этой области. По-видимому, только правая граница в ее естественной ориентации важна для переноса Т-ДНК и, возможно, для ее интеграции в геном клетки-хозяина.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > T DNA borders
-
7 site
1) место, участок, область2) мол. ген. сайтantibody active site — антигенсвязывающий [активный] центр антитела, рецепторная зона, паратоп, антидетерминанта
antigen-binding site — 1) антигенсвязывающий [активный] центр антитела, рецепторная зона, паратоп, антидетерминанта 2) ( клеточный) рецептор антигена (напр. поверхностный иммуноглобулин)
antigen-combining site — 1) антигенсвязывающий [активный] центр антитела, рецепторная зона, паратоп, антидетерминанта 2) ( клеточный) рецептор антигена (напр. поверхностный иммуноглобулин)
antigenic site — 1) область детерминанты ( в молекуле антигена) 2) иммунодоминантный сайт ( кластер высокоиммуногенных антигенных детерминант на поверхности вириона)
assembly sites — сайты [участки] сборки (специальные области на микрофиламентах, играющие ключевую роль в процессе сборки вирусной частицы)
B-cell-activating site — сайт активации B-клеток (иммуногенная область субъединичной вакцины, ответственная за индукцию гуморального иммунитета у реципиента)
cap site — сайт кэпирования, кэп-сайт (нуклеотидная последовательность в 5'-концевой области гена, узнаваемая РНК-полимеразой)
chain-antigenic site — антигенная детерминанта секвенциального типа, секвенциальный эпитоп
combining site — антигенсвязывающий [активный] центр антитела, рецепторная зона, паратоп, антидетерминанта
complement fixation site — комплементсвязывающий участок, сайт фиксации комплемента
complement fixing site — комплементсвязывающий участок, сайт фиксации комплемента
consensus end site — сигнал об окончании считывания ( последовательности нуклеотидов); сайт терминации транскрипции
cryptic recognition site — скрытый [маскированный] сайт узнавания (сайт узнавания, недоступный для связывания с лигандом в обычных условиях)
ectopic site — эктопический участок, эктопическая область
hidden valence site — скрытая [латентная] антигенная детерминанта, криптотоп
implantation site — место имплантации, имплантационный сайт
infrequently cutting restriction site — маскированный (напр. защищенный модификацией) сайт рестрикции
insensitized skin site — интактный ( несенсибилизированный) участок поверхности кожи
insertion site — инсерционный сайт, сайт интеграции
mRNA-splicing site — сигнал для сплайсинга мРНК (особая последовательность нуклеотидов в областях экзон-интронных стыков молекулы пре-мРНК, узнаваемая ферментами сплайсинга)
overlapping site — перекрывающийся участок, перекрывающаяся последовательность ( нуклеотидов)
paratopic site — антигенсвязывающий [активный] центр антитела, рецепторная зона, паратоп, антидетерминанта
Paul-Bunnell site — сайт Пауля-Буннелля ( область связывания антигена Пауля-Буннелля на мембране эритроцита)
polyadenylation site — сайт полиаденилирования, поли(A)-сайт
privileged site — пермиссивный участок, привилегированная область ( размещения и приживления трансплантата)
promoter site — сайт инициации транскрипции, промоторный участок, промотор
rare-cutting restriction site — маскированный (напр. защищённый модификацией) сайт рестрикции
reaction site — 1) реакционно-активный участок ( молекулы); область каталитического центра ( фермента) 2) аллергическая папула ( в месте введения антигена)
restriction site — сайт рестрикции (нуклеотидная последовательность, узнаваемая и расщепляемая рестрикционной эндонуклеазой)
structurally inherent antigenic site — структурированная антигенная детерминанта (эпитоп со структурой, формируемой нативной конформацией макромолекулы по Атази-Казиму)
switch site — сайт [область] переключения, свич-сайт (короткая последовательность ДНК, фланкирующая 5'-конец C-области гена тяжёлой цепи иммуноглобулина и выполняющая функции сайта узнавания при переключении экспрессии генов различных классов иммуноглобулинов)
T-cell-activating site — сайт активации T-клеток (иммуногенная область субъединичной вакцины, ответственная за индукцию T-клеточного иммунитета у реципиента)
T cell-antigen reaction site — T-клеточный участок взаимодействия с антигеном, T-клеточный антигенный рецептор
test site — область контакта с антигеном ( на коже), аппликационная зона
unbound site — свободный [незанятый] сайт связывания (на сорбенте, матрице, клетке)
unoccupied binding site — свободный [незанятый] сайт связывания (на сорбенте, матрице, клетке)
valence site — антигенная детерминанта, эпитоп
-
8 cloning vector
Вектор vector( плазмида plasmid или вирусная ДНК), предназначенный для клонирования тестируемых фрагментов ДНК.* * *Вектор клонирования, клонирующий в. — молекула нуклеиновой кислоты, которая способна автономно реплицироваться (см. Репликация) в хозяйской клетке и может включать в себя чужеродную ДНК. Вектор содержит свой собственный ориджин репликации (см. Репликации ориджин), один или более сайтов узнавания для рестрикционных эндонуклеаз, которые применяются для инсерции (встройки) чужеродной ДНК, а также селективные маркеры. Наиболее часто в качестве В.к. используются плазмиды или фаги.Экспрессионный вектор, э. клонирующий в., транскрипционный в. — плазмидная или фаговая клонирующая конструкция, специально сконструированная для эффективной транскрипции клонированной ДНК и трансляции соответствующей иРНК. Э. в. часто содержат экспрессионную кассету, включающую высокоактивную (сильную) промоторную (см. Промотор) последовательность (напр., lacUV5, trp, CfMV35S, хит-шоковые промоторы и др.), подходящий сайт для клонирования и сигнал терминации (окончания) транскрипции. Любой ген, клонированный в Э. в. в правильной позиции, экспрессируется с высокой эффективностью. Э. в. могут также содержать сайты для присоединения рибосом, что увеличивает надежность синтеза белка с иРНК, а также последовательности сигнальных пептидов, обеспечивающих секрецию вновь синтезированного белка (см. Ампликон-вектор. Индуцируемый экспрессионный вектор. Экспрессионный челночный вектор).Англо-русский толковый словарь генетических терминов > cloning vector
-
9 expression vector
Вектор vector, содержащий промоторную promoter и другие регуляторные последовательности, обеспечивающие эффективную транскрипцию рекомбинантного гена с последующей трансляцией мРНК и образованием рекомбинантного белка; в экспериментах по генной инженерии при конструировании эукариотических Э.в. наиболее часто используются промоторы гена металлотионеина metallothioneins мыши, вируса SV40 simian virus 40, гена фосфоглицераткиназы дрожжей и некоторые другие.* * *Вектор клонирования, клонирующий в. — молекула нуклеиновой кислоты, которая способна автономно реплицироваться (см. Репликация) в хозяйской клетке и может включать в себя чужеродную ДНК. Вектор содержит свой собственный ориджин репликации (см. Репликации ориджин), один или более сайтов узнавания для рестрикционных эндонуклеаз, которые применяются для инсерции (встройки) чужеродной ДНК, а также селективные маркеры. Наиболее часто в качестве В.к. используются плазмиды или фаги.Экспрессионный вектор, э. клонирующий в., транскрипционный в. — плазмидная или фаговая клонирующая конструкция, специально сконструированная для эффективной транскрипции клонированной ДНК и трансляции соответствующей иРНК. Э. в. часто содержат экспрессионную кассету, включающую высокоактивную (сильную) промоторную (см. Промотор) последовательность (напр., lacUV5, trp, CfMV35S, хит-шоковые промоторы и др.), подходящий сайт для клонирования и сигнал терминации (окончания) транскрипции. Любой ген, клонированный в Э. в. в правильной позиции, экспрессируется с высокой эффективностью. Э. в. могут также содержать сайты для присоединения рибосом, что увеличивает надежность синтеза белка с иРНК, а также последовательности сигнальных пептидов, обеспечивающих секрецию вновь синтезированного белка (см. Ампликон-вектор. Индуцируемый экспрессионный вектор. Экспрессионный челночный вектор).Англо-русский толковый словарь генетических терминов > expression vector
-
10 transcription vector
Вектор клонирования, клонирующий в. — молекула нуклеиновой кислоты, которая способна автономно реплицироваться (см. Репликация) в хозяйской клетке и может включать в себя чужеродную ДНК. Вектор содержит свой собственный ориджин репликации (см. Репликации ориджин), один или более сайтов узнавания для рестрикционных эндонуклеаз, которые применяются для инсерции (встройки) чужеродной ДНК, а также селективные маркеры. Наиболее часто в качестве В.к. используются плазмиды или фаги.Экспрессионный вектор, э. клонирующий в., транскрипционный в. — плазмидная или фаговая клонирующая конструкция, специально сконструированная для эффективной транскрипции клонированной ДНК и трансляции соответствующей иРНК. Э. в. часто содержат экспрессионную кассету, включающую высокоактивную (сильную) промоторную (см. Промотор) последовательность (напр., lacUV5, trp, CfMV35S, хит-шоковые промоторы и др.), подходящий сайт для клонирования и сигнал терминации (окончания) транскрипции. Любой ген, клонированный в Э. в. в правильной позиции, экспрессируется с высокой эффективностью. Э. в. могут также содержать сайты для присоединения рибосом, что увеличивает надежность синтеза белка с иРНК, а также последовательности сигнальных пептидов, обеспечивающих секрецию вновь синтезированного белка (см. Ампликон-вектор. Индуцируемый экспрессионный вектор. Экспрессионный челночный вектор).Англо-русский толковый словарь генетических терминов > transcription vector
См. также в других словарях:
Эндонуклеазы рестрикции — Эндонуклеазы рестрикции, рестриктазы (от лат. restrictio ограничение) группа ферментов, относящихся к классу гидролаз, катализирующих реакцию гидролиза нуклеиновых кислот. В отличие от экзонуклеаз, рестриктазы расщепляют… … Википедия
Адаптер адаптор — Адаптер, адаптор * адаптар * adapter or adaptor 1. Одноидидвунитевые олигонуклеотиды, предназначенные для объединения молекул с несоместимыми концами. У дуплексов концы разные: один конец ровный, а другой ступенчатый, либо оба конца ступенчатые.… … Генетика. Энциклопедический словарь
Гомеозисные гены — Гомеозисные гены детерминируют процессы роста и дифференцировки. Гомеозисные гены кодируют транскрипционные факторы, контролирующие программы формирования органов и тканей. Мутации в гомеозисных генах могут вызвать превращение одной части… … Википедия
Рестрикционные эндонуклеазы рестриктазы р ферменты — Рестрикционные эндонуклеазы, рестриктазы, р. ферменты * рэстрыкцыйныя эндануклеазы, рэстрыктазы, р. ферменты * restriction endonucleases or restriction enzymes любой бактериальный фермент, узнающий определенные нуклеотидные последовательности… … Генетика. Энциклопедический словарь
Полиморфизм ДНК — * полімарфізм ДНК * DNA polymorphism полиморфизм молекул ДНК вследствие мутаций, происходящих в некодирующих последовательностях, таких как сателлитная ДНК, умеренные повторы, интроны, спейсерные участки между генами. Эти мутации имеют… … Генетика. Энциклопедический словарь
Рестрикция — * рэстрыкцыя * restriction 1. Удаление чужеродной ДНК из бактерии путем деградации или расщепления ее специфическими бактериальными ферментами рестриктазами. Эндонуклеазы рестрикции, или рестриктазы (), узнают специфические последовательности для … Генетика. Энциклопедический словарь
Эндонуклеазы рестрикции рестриктазы — Эндонуклеазы рестрикции, рестриктазы * эндануклеазы рэстрыкцыі, рэстрыктазы * restriction еndonucleases ферменты, которые узнают специфические последовательности для разрезания (сайты узнавания, см.) и обычно состоят из 4 7 п. о. Бактериальная… … Генетика. Энциклопедический словарь
Сайт рестрикции сайт разрезания рестрикционными ферментами — Сайт рестрикции, сайт разрезания рестрикционными ферментами * сайт рэстрыкцыі, сайт разразання рэстрыкцыйнымі ферментамі * restriction site or restriction enzyme cutting site специфическая последовательность в молекуле ДНК, в месте расположения… … Генетика. Энциклопедический словарь
Рестрикционное картирование — * рэстрыкцыйнае картаванне * restriction mapping or r. analysis 1. Техника конструирования рестрикционной карты (см.) конкретного участка ДНК, позволяющая определять сайты узнавания (см.) различных рестриктаз (см.) II типа в линейном масштабе:… … Генетика. Энциклопедический словарь
Т-ДНК границы — * Т ДНК межы * T DNA borders прямые повторяющиеся последовательности размером в 25 п. о., фланкирующие Т область в Ti плазмиде (см.). Т ДНК T4 ДНК лигаза 765 г. очень важны для vir индуцируемого вырезания Т нити после контакта бактерии с клетками … Генетика. Энциклопедический словарь
Сайт рестрикции — (участок узнавания) короткая последовательность нуклеотидов в молекуле ДНК, которая распознаётся ферментом эндонуклеазой рестрикции модификации (рестриктазой). Рестриктаза связывается с молекулой ДНК в точке расположения сайта рестрикции и… … Википедия
